Homemyrkkyanalyysilla selvitetään rehussa mahdollisesti esiintyvät homemyrkyt. Näin voidaan selvittää tilalla mahdollisesti esiintyvien ongelmien syitä ja poissulkea homemyrkkyjen esiintymisen mahdollisuus. Analyysissä selvitetään seuraavien homemyrkkyjen esiintyminen: